Le Centre de Référence des Maladies rares en ophtalmologie recense de nombreuses pathologies :
- Achromatopsie congénitale
- Alacrymie congénitale
- Albinismes
- Amaurose congénitale de Leber
- Arthrite juvénile idiopathique
- Cataractes congénitales
- Causes rares d’uvéites antérieures, uvéites intermédiaires, uvéites postérieures
- Causes rares de pan uvéites
- Causes rares de sclérite
- Conjonctivite ligneuse
- Choroїdérémie
- Choroїdite serpigineuse
- Colobomes oculaires (irien, choriorétinien, papillaire)
- Cyclite hétérochromique de Fuchs
- Drépanocytose
- Dysgénésies du segment antérieur (anomalie d’Axenfeld, anomalie de Peters, anomalie de von Hippel, sclérocornée congénitale, aniridie)
- Dystrophies de cornée
- Dystrophie de Steinert
- Ectopies du cristallin
- Epidermolyses bulleuses dystrophiques
- Glaucomes congénitaux
- Gliomes de la voie optique
- Homocystinurie
- Incontinentia pigmenti
- Kératocône
- Maladie de Behcet
- Maladie de Coats
- Maladie de Fabry
- Maladie de Norrie
- Maladie de Stargardt
- Microphtalmies- Anophtalmie
- Microcorie congénitale
- Mucopolysaccharidose
- Neurofibromatose de type 1
- Neuropathies optiques héréditaires (Neuropathie optique de Leber, Neuropathie optique dominante autosomique, Neuropathie optique récessive autosomique)
- Nystagmus congénitaux
- Ophtalmie sympathique
- Persistance hyperplasie du vitré primitif
- Pseudoxanthome élastique
- Ptosis de causes rares (myopathies mitochondriales, syndrome de Kearns Sayre, myasthénie)
- Rétinoblastome
- Choriorétinopathie de type Birdshot
- Rétinopathies paranéoplasiques
- Rétinopathies pigmentaires non syndromiques et syndromiques (Syndromes d’Usher, Bardet Biedl, Alstrom- Joubert- Senior- Löken)
- Rétinoschisis lié à l’X
- Sarcoïdose de Besnier Boeck-Shaumann
- Sclérose tubéreuse de Bourneville
- Syndrome de Blepharophimosis- Epicantus
- Syndrome de Pierre Robin
- Syndrome d’Alport
- Syndrome d’Alagille
- Syndrome de C.H.A.R.G.E
- Syndrome d’hypoventilation alvéolaire centrale congénitale
- Syndrome de Marfan
- Syndrome de Moebius
- Syndrome de Rubinstein-Taybi
- Syndrome de Stilling- Duane -Türk
- Syndrome de Sturge-Weber-Krabbe
- Syndrome de Vogt-Koyanagi-Harada
- Syndrome de Weill-Marchesani
- Syndrome de Wolfram
- Trisomie 21